RNAprobR

DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAprobR

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RNAprobR．

基于RNA结构探测数据的大量并行测序分析的R包

Bioconductor版本:3.10

该软件包有助于分析下一代测序数据，其中单核苷酸分辨率的位置信息是关键。它允许在表或UCSC兼容的床图文件中应用不同类型的相关规范化、数据可视化和导出。

作者:Lukasz Jan Kielpinski [aut]， Nikos Sidiropoulos [cre, aut]， Jeppe Vinther [aut]

维护者:Nikos Sidiropoulos < Nikos。Sidiro在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("RNAprobR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“RNAprobR”)

PDF	R脚本	RNAprobR:一个R包，用于分析大量基于并行测序的RNA结构探测方法
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道，GenomeAnnotation，归一化，测序，软件
版本	1.18.0
在Bioconductor	BioC 3.1 (R-3.2)(5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (>= 3.1.1)，GenomicFeatures(> = 1.16.3),plyr(> = 1.8.1),BiocGenerics(> = 0.10.0)
进口	Biostrings(> = 2.32.1),GenomicRanges(> = 1.16.4),IRanges(> = 2.10.5),Rsamtools(> = 1.16.1),rtracklayer(> = 1.24.2),GenomicAlignments(> = 1.5.12),S4Vectors(>= 0.14.7)，图形，统计，utils
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	RNAprobR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	RNAprobR_1.18.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	RNAprobR_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAprobR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RNAprobR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RNAprobR/
软件包下载报告	下载数据