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RNAinteract
DOI:10.18129 / B9.bioc.RNAinteract
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RNAinteract。
估计成对从多维交互功能
Bioconductor版本:3.10
RNAinteract估计基因相互作用等多维家里从图像中提取特征。屏幕被认为是进行多井盘子或类似的设计。从一个列表的功能(如细胞数量、面积、荧光强度)每好,估计遗传交互。包提供了交互功能报告基因对,策划的热图和双RNAi情节。可以编写一个HTML报告质量控制和分析。
作者:贝恩德•菲舍尔< b。费舍尔在dkfz.de >
维护人员:贝恩德•菲舍尔< b。费舍尔在dkfz.de >
从内部引用(R,回车引用(“RNAinteract”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RNAinteract”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“RNAinteract”)
| R脚本 | RNAinteract | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | CellBasedAssays,ImmunoOncology,预处理,质量控制,软件,可视化 |
| 版本 | 1.34.0 |
| Bioconductor自 | BioC 2.8 (r - 2.13)(9年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 2.12.0),abind,locfit,Biobase |
| 进口 | RColorBrewer,ICS,ICSNP,cellHTS2,geneplotter,gplots、网格hwriter,晶格,latticeExtra,limma、方法、splots(> = 1.13.12) |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | RNAinteractMAPK |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | RNAinteract_1.34.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RNAinteract_1.34.0.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | RNAinteract_1.34.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RNAinteract |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RNAinteract |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RNAinteract/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
