此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅rmassbank。
生物导体版本:3.10
工作流程以处理串联MS文件并构建Massbank记录。功能包括串联MS光谱的自动提取,对串联MS片段的公式分配,带有分配片段的串联MS光谱,光谱清理,从Internet数据库中自动检索化合物信息以及导出到Massbank Records。
作者:Michael Stravs,Emma Schymanski,Steffen Neumann,Erik Mueller,来自Tobias Schulze的贡献
维护者:Eawag
引用(从r内,输入引用(“ rmassbank”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ rmassbank”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ rmassbank”)
R脚本 | rmassbank非标准用法 | |
R脚本 | rmassbank使用XCMS演练 | |
R脚本 | Rmassbank演练 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 生物信息学,,,,免疫学,,,,质谱,,,,代谢组学,,,,软件 |
版本 | 2.14.1 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(7。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | RCPP |
进口 | XML,,,,rcurl,,,,rjson,,,,S4VECTORS,,,,消化,,,,rcdk,,,,Yaml,,,,MZR, 方法,生物酶,,,,MSNBase,,,,httr |
链接 | |
建议 | GPLOTS,,,,rmassbankdata,,,,XCMS(> = 1.37.1),相机,,,,运行,,,,Envipat |
系统要求 | OpenBabel |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | rmassbankdata |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | rmassbank_2.14.1.tar.gz |
Windows二进制 | rmassbank_2.14.1.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | rmassbank_2.14.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rmassbank |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/rmassbank |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/rmassbank/ |
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