- 家
- Biocumon 3.10
- 软件包
- Ripseeker.
Ripseeker.
DOI：10.18129 / b9.bioc.ripseeker.
此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅Ripseeker.。
RIPSEEKER：用于鉴定来自RIP-SEQ实验的蛋白质相关转录物的统计包装
生物导体版本：3.10
从RIP-SEQ对齐使用具有负二进制发射概率的两个状态HMM来推断和区分RIP峰值。虽然RIPSeeker专门针对RIP-SEQ数据分析量身定制，但它还提供了一套集成在此独立软件包中的生物信息工具套件，全面解决从后对齐处理和注释的问题传播的问题。
作者：岳丽
维护者：yue li
引文（从R内，输入引文（“RIPSEEKER”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：
if（！qualocmanespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“ripseeker”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“RIPSEEKER”）
| PDF. | r script. | RIPSEEKER：用于鉴定来自RIP-SEQ实验的蛋白质相关转录物的统计包装 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | RIPSEQ.那测序那软件 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 2.12（R-3.0）（7年） |
| 执照 | GPL-2 |
| 依靠 | R（> = 2.15），方法，S4Vectors.（> = 0.9.25），绞喉那Genomicranges.那概括分析那RSAMTOOLS.那基因管理那rtracklayer. |
| 进口 | |
| 链接到 | |
| 建议 | 生物雕那Chippeakanno.， 平行，基因组法 |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | http://www.cs.utortono.ca/~yueli/software.html. |
| 取决于我 | Ripseekerdata. |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | RIPSEEKER_1.26.0.TAR.GZ. |
| Windows二进制文件 | RIPSEEKER_1.26.0.zip. |
| Mac OS x 10.11（El Capitan） | RIPSEEKER_1.26.0.TGZ. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/ripseeker. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包/ Ripseeker |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/ripseeker/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
