此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RGSEA.
Bioconductor版本:3.10
RGSEA结合了自举聚合和基因集富集分析(Gene set enrichment analysis, GSEA),是一种鲁棒性高、不存在过拟合问题的分类算法。特别是对不同实验数据的处理效果较好。
作者:马成成
维护者:Ma Chengcheng
引文(从R内,输入引用(“RGSEA”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("RGSEA")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RGSEA”)
R脚本 | RGSEA简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 分类,GeneSetEnrichment,软件,StatisticalMethod |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年) |
许可证 | GPL (> = 3) |
取决于 | R (>= 2.10.0) |
进口 | BiocGenerics |
链接 | |
建议 | BiocStyle,GEOquery,knitr,RUnit |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | RGSEA_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | RGSEA_1.20.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | RGSEA_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RGSEA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RGSEA |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RGSEA/ |
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