RGSEA

DOI:10.18129 / B9.bioc.RGSEA

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RGSEA

随机基因集富集分析

Bioconductor版本:3.10

RGSEA结合了自举聚合和基因集富集分析(Gene set enrichment analysis, GSEA),是一种鲁棒性高、不存在过拟合问题的分类算法。特别是对不同实验数据的处理效果较好。

作者:马成成

维护者:Ma Chengcheng

引文(从R内,输入引用(“RGSEA”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("RGSEA")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RGSEA”)

PDF R脚本 RGSEA简介
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类GeneSetEnrichment软件StatisticalMethod
版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.0 (R-3.1)(5.5年)
许可证 GPL (> = 3)
取决于 R (>= 2.10.0)
进口 BiocGenerics
链接
建议 BiocStyleGEOqueryknitrRUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 RGSEA_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 RGSEA_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) RGSEA_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RGSEA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RGSEA
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RGSEA/
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