此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅redseq。
生物导体版本:3.10
该软件包包括构建限制酶切割位点(REC)地图的功能,使用五种不同的方法在地图上分布映射的序列,为样品找到富集/耗尽的REC,并识别样品之间的差异丰富/耗尽的REC。
作者:Lihua Julie Zhu和Thomas Fazzio
维护者:Lihua Julie Zhu
引用(从r内,输入引用(“ redseq”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ redseq”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ redseq”)
R脚本 | Redseq小插图 | |
参考手册 |
生物浏览 | 预处理,,,,测序,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.32.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.9(R-2.14)(8。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 2.15.0),生物基因(> = 0.1.0),bsgenome.celegans.ucsc.ce2,,,,多检验,,,,生物弦,,,,BSGENOME,,,,Chippeakanno |
进口 | 生物基因,,,,AnnotationDbi,,,,生物弦,,,,Chippeakanno,图形,iranges(> = 1.13.5),多检验,统计,utils |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | redseq_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | redseq_1.32.0.zip(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | redseq_1.32.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/redseq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/redseq |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/redseq/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |