RDAVIDWebService

DOI:10.18129 / B9.bioc.RDAVIDWebService

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅RDAVIDWebService。

为检索数据从大卫到R R包对象使用Web服务API。

Bioconductor版本:3.10

注释工具,用于从数据库中检索数据,可视化和发现(大卫)使用Web服务集成到R对象。这个包提供了大卫的网站的主要功能包括:1)用户友好连接上传基因/背景列表/ s,改变基因/背景位置,选择当前的形式/ s,选择注释,等等(二)提交的报告基因列表,注释类别汇总,基因/术语集群、功能注释图、功能注释表

作者:克里斯托瓦尔弗雷斯诺和埃尔默费尔南德斯

维护人员:克里斯托瓦尔弗雷斯诺< cfresno在bdmg.com.ar >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“RDAVIDWebService”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“RDAVIDWebService”)

PDF	R脚本	大卫RDAVIDWebService:多功能R接口
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GraphAndNetwork,软件,可视化
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 2.14.1)、方法图,GOstats,ggplot2
进口	类别,GO.db,RBGL,rJava
链接
建议	Rgraphviz
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bdmg.com.arhttp://david.abcc.ncifcrf.gov/
取决于我	CompGO
进口我
建议我	FGNet,IntramiRExploreR
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	RDAVIDWebService_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	RDAVIDWebService_1.24.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	RDAVIDWebService_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RDAVIDWebService
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ RDAVIDWebService
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/RDAVIDWebService/
包下载报告	下载数据