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RCM
DOI:10.18129 / B9.bioc.RCM
此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见RCM．
用负二项分布拟合微生物组的行-列关联模型
Bioconductor版本:3.10
结合列联表的对数线性分析、灵活响应函数估计和经验贝叶斯离散估计的思想，用于微生物组数据集的探索性可视化。该软件包包括无约束分析和有约束分析。
作者:Stijn Hawinkel < Stijn。Hawinkel在ugent, be>
维护者:Joris Meys < Joris。Meys at ugent.be>
引文(从R内，输入引用(RCM))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("RCM")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes (RCM)
| 超文本标记语言 | R脚本 | RCM包的手册 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DimensionReduction，宏基因组，微生物组，软件，可视化 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(1年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | |
| 进口 | RColorBrewer，阿拉巴马州，刨边机，reshape2，tseries，素食主义者，VGAM，ggplot2(> = 2.2.1.9000),nleqslv，phyloseq，张量，质量，统计，grDevices，图形，方法 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr，rmarkdown，testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://users.ugent.be/~shawinke/RCMmanual/ |
| BugReports | https://github.com/CenterForStatistics-UGent/RCM/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | RCM_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | RCM_1.2.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | RCM_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RCM |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RCM |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RCM/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
