此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅R3CPET。
生物导体版本:3.10
该软件包提供了一种推断蛋白质集的方法,这些蛋白质可能更有可能一起工作以维持CHIA-PET实验结果。
作者:Djekidel MN,Yang Chen等。
维护者:穆罕默德·纳德(Mohamed Nadhir Djekidel)
引用(从r内,输入引用(“ r3cpet”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ r3cpet”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ r3cpet”)
R脚本 | 3CPET:查找维持CHIA-PET相互作用的共同因素复合物 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 贝叶斯,,,,基因表达,,,,遗传,,,,GraphandNetwork,,,,嗝,,,,网络,,,,网络引导,,,,软件 |
版本 | 1.18.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | r(> = 3.2),RCPP(> = 0.10.4),方法 |
进口 | 方法,并行,线索,,,,GGPLOT2,,,,pheatmap,,,,clvalid,,,,Igraph,,,,Data.Table,,,,RESHAPE2,,,,HMISC,,,,rcurl,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges(> = 2.13.12),GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.31.8),GGBIO |
链接 | RCPP |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,Biovizbase,,,,Biomart,,,,AnnotationDbi,,,,org.hs.eg.db,,,,闪亮的,,,,Chippeakanno |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/sirusb/r3cpet/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | r3cpet_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | R3CPET_1.18.0.ZIP(32-和64位) |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | r3cpet_1.18.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r3cpet |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/r3cpet |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/r3cpet/ |
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