R3CPET

doi:10.18129/b9.bioc.r3cpet

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅R3CPET

3CPET:使用分层dirichlet过程在CHIA-PET实验中查找副因素复合物

生物导体版本:3.10

该软件包提供了一种推断蛋白质集的方法,这些蛋白质可能更有可能一起工作以维持CHIA-PET实验结果。

作者:Djekidel MN,Yang Chen等。

维护者:穆罕默德·纳德(Mohamed Nadhir Djekidel)

引用(从r内,输入引用(“ r3cpet”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ r3cpet”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ r3cpet”)

PDF R脚本 3CPET:查找维持CHIA-PET相互作用的共同因素复合物
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 贝叶斯,,,,基因表达,,,,遗传,,,,GraphandNetwork,,,,,,,,网络,,,,网络引导,,,,软件
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(5年)
执照 GPL(> = 2)
要看 r(> = 3.2),RCPP(> = 0.10.4),方法
进口 方法,并行,线索,,,,GGPLOT2,,,,pheatmap,,,,clvalid,,,,Igraph,,,,Data.Table,,,,RESHAPE2,,,,HMISC,,,,rcurl,,,,生物基因,,,,S4VECTORS,,,,iranges(> = 2.13.12),GenomeInfodB,,,,基因组机(> = 1.31.8),GGBIO
链接 RCPP
建议 生物使用,,,,尼特,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg19,,,,Biovizbase,,,,Biomart,,,,AnnotationDbi,,,,org.hs.eg.db,,,,闪亮的,,,,Chippeakanno
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/sirusb/r3cpet/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 r3cpet_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 R3CPET_1.18.0.ZIP(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) r3cpet_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/r3cpet
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/r3cpet
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/r3cpet/
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