王子

DOI:10.18129 / B9.bioc.PrInCE

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅王子。

预测从Co-Elution Interactomes

Bioconductor版本:3.10

王子(从Co-Elution预测Interactomes)使用朴素贝叶斯分类器训练dataset-derived功能恢复蛋白质-蛋白质之间的关系从Co-Elution色谱配置文件。这个包包含的R实现王子。

作者:迈克尔Skinnider (aut, trl cre), r·格雷格•斯泰西[所有]Nichollas斯科特(施),安德斯Kristensen[所有],伦纳德·福斯特(aut,)

维护人员:迈克尔Skinnider <迈克尔。在msl.ubc.ca skinnider >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“王子”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“王子”)

HTML	R脚本	与王子从co-elution Interactome重建数据
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	NetworkInference,蛋白质组学,软件,SystemsBiology
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(1年)
许可证	GPL-3 +文件许可证
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	purrr(> = 0.2.4),dplyr(> = 0.7.4),tidyr(> = 0.8.99),预测(> = 8.2),进步(> = 1.1.2),Hmisc(> = 4.0),naivebayes(> = 0.9.1),robustbase(0.92 > = 7),管理员(> = 0.8.0),LiblineaR(> = 2.10 8),speedglm(> = 0.3 - 2),测试人员(> = 0.1.7),magrittr(> = 1.5),Biobase(> = 2.40.0),MSnbase跑龙套,(> = 2.8.3),统计方法,Rdpack(> = 0.7)
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/fosterlab/PrInCE/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	PrInCE_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	PrInCE_1.2.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	PrInCE_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PrInCE
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/王子
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PrInCE/
包下载报告	下载数据