PharmacoGx

DOI:10.18129 / B9.bioc.PharmacoGx

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PharmacoGx

大规模药物基因组学数据分析

Bioconductor版本:3.10

包含一组功能,执行大规模的药物基因组数据分析。

作者:Petr Smirnov, Zhaleh Safikhani, Mark Freeman, Benjamin Haibe-Kains

维护者:Benjamin Haibe-Kains < Benjamin .haibe。Kains at utoronto.ca>

引文(从R内,输入引用(“PharmacoGx”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“PharmacoGx”)

PDF R脚本 创建PharmacoSet对象
PDF R脚本 PharmacoGx:用于分析大型药物基因组数据集的R包
PDF 参考手册
文本 自述

细节

biocViews 分类GeneExpression遗传药理学药物基因组学软件
版本 1.17.1
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.6)
进口 Biobase钢琴magicaxisRColorBrewer平行,caTools、方法、下载器,统计,utils,图形,grDevices,文理学院reshape2
链接
建议 xtabletestthat
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/bhklab/PharmacoGx/issues
全靠我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 PharmacoGx_1.17.1.tar.gz
Windows二进制 PharmacoGx_1.17.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) PharmacoGx_1.17.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PharmacoGx
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PharmacoGx
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PharmacoGx/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网