PBase

doi:10.18129/b9.bioc.pbase

这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。

此软件包适用于生物导体的3.10版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅PBase

操纵和探索蛋白质和蛋白质组学数据

生物导体版本:3.10

在蛋白质组学实验的背景下研究和理解蛋白质序列数据的一组类和功能。

作者:Laurent Gatto [AUT,CRE],Johannes Rainer [AUT],Sebastian Gibb [aut]

维护者:laurent Gatto

引用(从r内,输入引用(“ PBASE”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pbase”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ PBASE”)

html R脚本 PBASE数据
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 DataImport,,,,datarepresentation,,,,免疫学,,,,基础设施,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化
版本 0.26.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 2.10),方法,生物基因,,,,RCPP,,,,GVIZ
进口 切肉刀(> = 1.3.6),生物酶,,,,生物弦(> = 2.47.5),iranges(> = 2.13.11),S4VECTORS(> = 0.17.24),mzid,,,,MZR(> = 1.99.1),MSNBase(> = 1.15.5),PVIZ,,,,Biomart,,,,基因组机(> = 1.31.7),rtracklayer(> = 1.39.6),Ensembldb(> = 1.99.13),生物比较,,,,AnnotationFilter
链接
建议 测试(> = 0.8),GGPLOT2,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,AnnotationHub,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,ensdb.hsapiens.v86(> = 2.0.0)
系统要求
增强
URL https://github.com/computitationalproteomicsunit/pbase
BugReports https://github.com/computationalProteomicSunit/pbase/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pbase_0.26.0.tar.gz
Windows二进制 pbase_0.26.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) pbase_0.26.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pbase
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pbase
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/pbase/
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