这个包是弃用。它可能会从生物导体中取出。请参考包装终止指南了解更多信息。
此软件包适用于生物导体的3.10版。该软件包已从生物导体中删除。有关最后一个稳定的最新版本版本,请参阅PBase。
生物导体版本:3.10
在蛋白质组学实验的背景下研究和理解蛋白质序列数据的一组类和功能。
作者:Laurent Gatto [AUT,CRE],Johannes Rainer [AUT],Sebastian Gibb [aut]
维护者:laurent Gatto
引用(从r内,输入引用(“ PBASE”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pbase”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ PBASE”)
html | R脚本 | PBASE数据 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | DataImport,,,,datarepresentation,,,,免疫学,,,,基础设施,,,,质谱,,,,蛋白质组学,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 0.26.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 2.10),方法,生物基因,,,,RCPP,,,,GVIZ |
进口 | 切肉刀(> = 1.3.6),生物酶,,,,生物弦(> = 2.47.5),iranges(> = 2.13.11),S4VECTORS(> = 0.17.24),mzid,,,,MZR(> = 1.99.1),MSNBase(> = 1.15.5),PVIZ,,,,Biomart,,,,基因组机(> = 1.31.7),rtracklayer(> = 1.39.6),Ensembldb(> = 1.99.13),生物比较,,,,AnnotationFilter |
链接 | |
建议 | 测试(> = 0.8),GGPLOT2,,,,bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38,,,,txdb.hsapiens.ucsc.hg38.nown,,,,AnnotationHub,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,ensdb.hsapiens.v86(> = 2.0.0) |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/computitationalproteomicsunit/pbase |
BugReports | https://github.com/computationalProteomicSunit/pbase/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | pbase_0.26.0.tar.gz |
Windows二进制 | pbase_0.26.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | pbase_0.26.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pbase |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/pbase |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/pbase/ |
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