Path2PPI

DOI:10.18129 / B9.bioc.Path2PPI

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见Path2PPI．

通路相关蛋白质-蛋白质相互作用网络的预测

Bioconductor版本:3.10

用于预测目标生物体中的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，其中只有关于PPI的视图信息可用。Path2PPI基于一组蛋白质预测PPI网络，这些蛋白质可能属于已建立的模式生物的某种途径。它有助于将某一途径或生物过程的信息从几个参考生物组合和传递到一个目标生物。Path2PPI仅依赖于所涉及蛋白质的序列相似性。

作者:奥利弗·菲利普[aut, cre]，伊娜·科赫[ctb]

维护者:Oliver Philipp

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("Path2PPI")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“Path2PPI”)

超文本标记语言	R脚本	Path2PPI -一个简短的教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	网络，NetworkInference，通路，蛋白质组学，软件，SystemsBiology
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.2.1)，igraph(>= 1.0.1)，方法
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.bioinformatik.uni-frankfurt.de/
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	Path2PPI_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	Path2PPI_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	Path2PPI_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Path2PPI
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Path2PPI
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Path2PPI/
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