PanVizGenerator

DOI:10.18129 / B9.bioc.PanVizGenerator

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见PanVizGenerator．

从你的泛基因组生成PanViz可视化

Bioconductor版本:3.10

PanViz是一个基于JavaScript的泛基因组功能注释可视化工具。PanVizGenerator是PanViz的伙伴，它促进了创建工作PanViz可视化所需的必要数据预处理步骤。输出是完全独立的，因此可视化的接收者不需要安装R或PanVizGenerator。

作者:Thomas Lin Pedersen

维护者:Thomas Lin Pedersen

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“PanVizGenerator”)

超文本标记语言	R脚本	使用PanVizGenerator创建PanViz可视化
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ComparativeGenomics，GUI，软件，可视化
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(4年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	方法
进口	闪亮的、工具、jsonlite，pcaMethods，FindMyFriends，igraph，统计，效用
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，消化
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/thomasp85/PanVizGenerator
BugReports	https://github.com/thomasp85/PanVizGenerator/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	PanVizGenerator_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	PanVizGenerator_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	PanVizGenerator_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PanVizGenerator
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PanVizGenerator
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PanVizGenerator/
软件包下载报告	下载数据