此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PGSEA.
Bioconductor版本:3.10
基因集富集的参数分析
作者:Kyle Furge < Kyle。furge在vai.org>和Karl Dykema < Karl。在vai.org dykema >
维护者:Karl Dykema < Karl。在vai.org dykema >
引用(从R中,输入引用(“PGSEA”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("PGSEA")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“PGSEA”)
R脚本 | HOWTO: PGSEA | |
R脚本 | PGSEA示例工作流 | |
参考手册 |
biocViews | 微阵列,软件 |
版本 | 1.60.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.0 (R-2.5)(13年) |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (> = 2.10),GO.db,KEGG.db,AnnotationDbi,annaffy、方法、Biobase(> = 2.5.5) |
进口 | |
链接 | |
建议 | GSEABase,GEOquery,org.Hs.eg.db,hgu95av2.db,limma |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | GeneExpressionSignature |
进口我 | |
建议我 | gskb |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | PGSEA_1.60.0.tar.gz |
Windows二进制 | PGSEA_1.60.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | PGSEA_1.60.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PGSEA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PGSEA |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/PGSEA/ |
包下载报告 | 下载数据 |