PCAN

DOI:10.18129 / B9.bioc.PCAN

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见PCAN

表型一致性分析(PCAN)

Bioconductor版本:3.10

基于通路共识方法的表型比较。基于与候选基因相关的附加基因(例如通路或网络邻居),评估候选基因与一组表型之间的关系。

作者:马修·佩奇和帕特里斯·戈达尔

维护者:Matthew Page < Matthew。>和Patrice Godard < Patrice。戈达尔在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“PCAN”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("PCAN")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“PCAN”)

超文本标记语言 R脚本 评估一组表型的基因相关性
PDF 参考手册

细节

biocViews 注释FunctionalPrediction遗传学网络通路测序软件VariantAnnotation
版本 1.14.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(4年)
许可证 Cc by nc - nd 4.0
取决于 R (>= 3.3),BiocParallel
进口 grDevices,统计数据
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdownreactome.dbSTRINGdb
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 PCAN_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 PCAN_1.14.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) PCAN_1.14.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PCAN
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PCAN
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PCAN/
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