过去的

doi:10.18129/b9.bioc.past

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅过去的

途径协会研究工具(过去)

生物导体版本:3.10

过去采用GWAS输出并将SNP分配给基因,使用这些基因找到与基因相关的途径,并根据显着性绘制途径。实施用于读取GWAS输入数据的方法,查找与SNP相关的基因,计算富集评分和途径的重要性以及绘制途径。

作者:Thrash Adam [Cre,Aut],Deornellis Mason [AUT]

维护者:thrash adam

引用(从r内,输入引用(“过去”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“过去”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“过去”)

html R脚本 过去的
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 基因烯,,,,途径,,,,软件
版本 1.2.8
在生物导体中 Bioc 3.9(R-3.6)(1年)
执照 GPL(> = 3) +文件执照
要看 R(> = 3.6)
进口 统计,utils,dplyr,,,,rlang,,,,迭代器, 平行,foreach,,,,多帕尔,,,,QVALUE,,,,rtracklayer,,,,GGPLOT2,,,,基因组机,,,,S4VECTORS
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL https://github.com/igbb/past
BugReports https://github.com/igbb/past/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 过去_1.2.8.tar.gz
Windows二进制 过去_1.2.8.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) 过去_1.2.8.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/past
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/过去
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/past/
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