帕克
doi：10.18129/b9.bioc.papi
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅帕克。
根据代谢组学数据预测代谢途径活性
生物导体版本：3.10
途径活性分析-PAPI-是一个R包，用于仅基于代谢组学数据集预测代谢途径的活性，该数据集包含所鉴定的代谢物列表及其在不同生物样品中的各自丰度。Papi产生了改善最终生物学解释的假设。参见Aggio，R.B.M；Ruggiero，K。和Villas -Boas，S.G。（2010） - 途径活动分析（PAPI）：从代谢物谱到代谢途径活动。生物信息学。
作者：拉斐尔·阿吉奥（Raphael Aggio）
维护者：raphael aggio
引用（从r内，输入引用（“ Papi”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ papi”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Papi”）
| R脚本 | 应用PAPI | |
| Papi.pdf | ||
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 免疫学，，，，质谱，，，，代谢组学，，，，软件 |
| 版本 | 1.26.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.12（R-3.0）（7年） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 要看 | r（> = 2.15.2），svdialogs，，，，keggrest |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | papi_1.26.0.tar.gz |
| Windows二进制 | papi_1.26.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | papi_1.26.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/papi |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/papi |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/papi/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
