PAIRADISE

DOI:10.18129 / B9.bioc.PAIRADISE

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PAIRADISE。

PAIRADISE:配对分析微分同种型表达式

Bioconductor版本:3.10

这个包实现了PAIRADISE程序检测微分同种型表达式之间的匹配在成对RNA-Seq复制数据。

作者:沛Demirdjian,应年,易建联兴

维修工:羌胡<羌族。胡锦涛在roswellpark.org >,沛Demirdjian < levondem ucla.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PAIRADISE”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“PAIRADISE”)

HTML	R脚本	PAIRADISE
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	AlternativeSplicing,DifferentialExpression,ImmunoOncology,RNASeq,软件,StatisticalMethod
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6),nloptr
进口	SummarizedExperiment,S4Vectors、统计数据、方法abind,BiocParallel <