PADOG

DOI:10.18129 / B9.bioc.PADOG

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见PADOG．

降低重叠基因权重的途径分析(PADOG)

Bioconductor版本:3.10

这个包实现了一种通用的基因集分析方法，称为PADOG，它淡化了在要分析的基因集中经常出现的基因的重要性。该软件包还提供了基因集分析方法的敏感性和排名基准，使用KEGGdzPathwaysGEO软件包中的24个公共数据集。

作者:Adi Laurentiu Tarca ;徐仲辉<仲辉。徐在gmail.com>

维护者:Adi Laurentiu Tarca

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("PADOG")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“PADOG”)

PDF	R脚本	PADOG
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列，OneChannel，软件，TwoChannel
版本	1.28.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(7.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.0.0)，KEGGdzPathwaysGEO、方法、Biobase
进口	limma，AnnotationDbi，GSA，foreach，doRNG，hgu133plus2.db，hgu133a.db，KEGG.db，nlme
链接
建议	doParallel、并行
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	BLMA
进口我	EGSEA
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	PADOG_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	PADOG_1.28.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	PADOG_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PADOG
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/PADOG
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PADOG/
软件包下载报告	下载数据