PAA

DOI:10.18129 / B9.bioc.PAA

这个包是版本3.10的Bioconductor;有关稳定的最新发布版本，请参见PAA．

蛋白质阵列分析仪

Bioconductor版本:3.10

PAA导入以gpr文件格式保存的单色(蛋白质)微阵列数据-特别是ProtoArray数据。在预处理(背景校正、批处理滤波、归一化)之后，进行单变量特征预选(例如，使用“最小M统计量”方法-以下简称“mm”)。随后，进行多变量特征选择以发现候选生物标志物。因此，可以使用基于频率的反向消除方法或集成特征选择。PAA提供了一个完整的分析工具工具箱，包括几种不同的结果检查和评估图。

作者:迈克尔·图雷维奇[加拿大，加拿大]，马丁·艾森acher[加拿大，加拿大]

维护者:Michael Turewicz < Michael。马丁·艾森纳彻(Martin Eisenacher)Eisenacher在rub.de b>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("PAA")

对于旧版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，启动R并输入:

browseVignettes (PAA)

PDF	R脚本	PAA教程
PDF		PAA_1.7.1.pdf
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	分类，微阵列，OneChannel，蛋白质组学，软件
版本	1.20.0
在Bioconductor中	BioC 3.0 (R-3.1)(5.5岁)
许可证	BSD_3_clause +文件许可证
取决于	R (>= 3.2.0)，Rcpp(> = 0.11.6)
进口	e1071，gplots，gtools，limma，质量，mRMRe，randomForest，ROCR，股东价值分析
链接	Rcpp
建议	BiocStyle，RUnit，BiocGenerics，vsn
SystemRequirements	c++软件包随机丛林
增强了
URL	http://www.ruhr-uni-bochum.de/mpc/software/PAA/
这取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在您的R会话中使用此包的说明。

源包	PAA_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	PAA_1.20.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	PAA_1.20.0.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/PAA
源存储库(开发人员访问)	git clone git@git.bioconductor.org:packages/PAA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PAA/
软件包下载报告	下载数据