奥纳西斯

DOI:10.18129 / B9.bioc.Onassis

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见奥纳西斯

OnASSIs本体注释和语义相似性软件

Bioconductor版本:3.10

一个包,允许使用本体术语(主要来自OBO本体)注释文本,并基于不同注释样本之间的本体结构计算语义相似性度量。

作者:Eugenia Galeota

维护者:Eugenia Galeota < Eugenia。Galeota在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“奥纳西斯”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Onassis")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“奥纳西斯”)

超文本标记语言 R脚本 Onassis:本体注释和语义相似性软件
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释聚类DataImportGeneTarget网络软件
版本 1.8.2
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.4),rJavaOnassisJavaLibs
进口 GEOmetadbRSQLitedata.table,方法,工具,utils,AnnotationDbiRCurl统计数据,DTdata.tableknitrRtsnedendextendclustevalggplot2ggfortify
链接
建议 BiocStylermarkdownhtmltoolsorg.Hs.eg.dbgplotsGenomicRangeskableExtra
SystemRequirements Java (>= 1.8)
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 Onassis_1.8.2.tar.gz
Windows二进制 Onassis_1.8.2.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) Onassis_1.8.2.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Onassis
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Onassis
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Onassis/
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