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OmnipathR
DOI:10.18129 / B9.bioc.OmnipathR
这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅OmnipathR。
进口Omnipath网络
Bioconductor版本:3.10
导入数据从https://www.omnipathdb.org网络服务。它还包括函数变换和打印数据。
作者:匈奴王伽柏,窝Turei,阿尔贝托Valdeolivas
维护人员:阿尔贝托Valdeolivas Urbelz < alvaldeolivas gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“OmnipathR”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“OmnipathR”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“OmnipathR”)
| R脚本 | OmnipathR:效用函数与Omnipath R | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DataImport,DataRepresentation,GraphAndNetwork,网络,通路,软件,ThirdPartyClient |
| 版本 | 1.0.1 |
| Bioconductor自 | BioC 3.10 (r - 3.6)(< 6个月) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | igraph、图形方法,跑龙套 |
| 进口 | dplyr,rlang |
| 链接 | |
| 建议 | tidyr,dnet,gprofiler2,BiocStyle,testthat |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/saezlab/OmnipathR |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | OmnipathR_1.0.1.tar.gz |
| Windows二进制 | OmnipathR_1.0.1.zip |
| Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) | OmnipathR_1.0.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OmnipathR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ OmnipathR |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/OmnipathR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
