MinimumDistance

DOI:10.18129 / B9.bioc.MinimumDistance

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MinimumDistance。

一个包在Case-Parent新创CNV检测三人小组

Bioconductor版本:3.10

分析新创拷贝数变异的三人小组从高维基因分型平台。

作者:罗伯特B Scharpf和Ingo Ruczinski

维护人员:罗伯特B Scharpf < rscharpf jhu.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MinimumDistance”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MinimumDistance”)

PDF	R脚本	新创检测拷贝数改变case-parent三人小组
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CopyNumberVariation,微阵列,单核苷酸多态性,软件
版本	1.30.0
Bioconductor自	BioC 2.10 (r - 2.15)(8年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.3),VanillaICE(> = 1.47.1)
进口	方法,BiocGenerics,Biobase,S4Vectors(> = 0.23.18),IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges(> = 1.17.16),SummarizedExperiment(> = 1.15.4),oligoClasses,DNAcopy,ff,foreach,matrixStats,晶格,data.table、网格数据,跑龙套
链接
建议	human610quadv1bCrlmm(> = 1.0.3),BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,SNPchip,RUnit
SystemRequirements
增强了	雪,doSNOW
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MinimumDistance_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	MinimumDistance_1.30.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MinimumDistance_1.30.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MinimumDistance
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MinimumDistance
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MinimumDistance/
包下载报告	下载数据