MethylSeekR

DOI:10.18129 / B9.bioc.MethylSeekR

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MethylSeekR。

Bis-seq数据的分割

Bioconductor版本:3.10

这是一个包从Bis-seq数据监管发现的地区

作者:卢卡斯汉堡,Dimos Gaidatzis,德克Schubeler和迈克尔·施

维护人员:卢卡斯汉堡<卢卡斯。汉堡在fmi.ch >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MethylSeekR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MethylSeekR”)

PDF	R脚本	MethylSeekR
PDF		参考手册

细节

biocViews	DNAMethylation,MethylSeq,测序,软件
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 2.12 (r - 3.0)(7年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	rtracklayer(> = 1.16.3),并行(> = 2.15.1),mhsmm(> = 0.4.4)
进口	IRanges(> = 1.16.3),BSgenome(> = 1.26.1),GenomicRanges(> = 1.10.5),geneplotter(> = 1.34.0)、图形(> = 2.15.2)grDevices(> = 2.15.2),并行(> = 2.15.2),数据(> = 2.15.2),跑龙套(> = 2.15.2)
链接
建议	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg18
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	methylPipe,RnBeads
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MethylSeekR_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	MethylSeekR_1.26.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MethylSeekR_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MethylSeekR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MethylSeekR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MethylSeekR/
包下载报告	下载数据