MetaboSignal

DOI:10.18129 / B9.bioc.MetaboSignal

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见MetaboSignal．

代谢信号:一种基于网络的方法，覆盖和探索代谢和信号KEGG通路

Bioconductor版本:3.10

metabolsignal是一个R包，允许合并，分析和定制代谢和信号KEGG通路。它是一种基于网络的方法，旨在探索基因(信号-或酶-基因)和代谢物之间的拓扑关系，代表了一个强大的工具来研究遗传景观和代谢表型的调节网络。

作者:Andrea Rodriguez-Martinez, Rafael Ayala, Joram M. Posma, Ana L. Neves, Maryam Anwar, Jeremy K. Nicholson, Marc-Emmanuel Dumas

维护者:Andrea Rodriguez-Martinez < Andrea。罗德里格斯-马丁内兹13在imperial.ac。英国>，拉斐尔阿亚拉

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MetaboSignal")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MetaboSignal”)

超文本标记语言	R脚本	MetaboSignal
超文本标记语言	R脚本	代谢信号2:合并KEGG与额外的交互资源
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneSignaling，GeneTarget，GraphAndNetwork，KEGG，网络，通路，Reactome，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.3)
进口	KEGGgraph，hpar，igraph，RCurl，KEGGREST，EnsDb.Hsapiens.v75，统计，图形，utils，org.Hs.eg.db，biomaRt，AnnotationDbi，MWASTools，mygene
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，knitr，BiocStyle，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MetaboSignal_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	MetaboSignal_1.16.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MetaboSignal_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MetaboSignal
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MetaboSignal
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MetaboSignal/
软件包下载报告	下载数据