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梅丽莎
DOI:10.18129 / B9.bioc.Melissa
此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见梅丽莎．
单细胞甲基组的贝叶斯聚类和推断
Bioconductor版本:3.10
Melissa是一个联合聚类和输入单细胞甲基组的贝叶斯概率模型。这是通过考虑使用广义线性模型方法的局部相关性和使用混合建模方法的全局相似性来实现的。
作者:C. A. Kapourani [aut, cre]
维护者:C. A. Kapourani
引文(从R内，输入引用(“梅丽莎”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“梅丽莎”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | 1:处理和过滤scBS-seq数据 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 2:利用Melissa对scBS-seq数据进行聚类和归因 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 贝叶斯，聚类，报道，DNAMethylation，表观遗传学，FeatureExtraction，GeneExpression，GeneRegulation，遗传学，ImmunoOncology，KEGG，RNASeq，回归，测序，SingleCell，软件 |
| 版本 | 1.2.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.9 (R-3.6)(1年) |
| 许可证 | GPL-3 |文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.5.0)，BPRMeth，GenomicRanges |
| 进口 | data.table平行,ROCR，matrixcalc，线索，ggplot2，doParallel，foreach，MCMCpack，cowplot，magrittr，mvtnorm，truncnorm，为了，BiocStyle，统计，效用 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Melissa_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Melissa_1.2.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | Melissa_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Melissa |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Melissa |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Melissa/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
