MaxContrastProjection

DOI:10.18129 / B9.bioc.MaxContrastProjection

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见MaxContrastProjection．

沿z维执行3D图像到2D的最大对比度投影

Bioconductor版本:3.10

在记录3D荧光显微镜图像时，一个问题是如何在2D中正确地呈现这些结果。最大强度投影是确定图像中每个像素焦平面的常用方法。然而，这种方法的问题是，失焦的元素仍然是可见的，使得边缘和精细结构难以检测。这个包旨在通过使用给定像素周围的对比度来确定焦平面来解决这个问题，允许比其他可能的更清晰的结构检测。为了方便起见，这个包还包含执行各种其他类型投影的函数，包括最大强度投影。

作者:Jan Sauer, Bernd Fischer

维护者:Jan Sauer < Jan。绍尔在dkfz-heidelberg.de>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MaxContrastProjection”)

PDF	R脚本	MaxContrastProjection
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，ImmunoOncology，预处理，软件，可视化
版本	1.10.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(3年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4)
进口	EBImage、统计数据、方法
链接
建议	knitr，BiocStyle，testthat
SystemRequirements	GNU使
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MaxContrastProjection_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	MaxContrastProjection_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	MaxContrastProjection_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MaxContrastProjection
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MaxContrastProjection
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MaxContrastProjection/
软件包下载报告	下载数据