mtseeker

doi:10.18129/b9.bioc.mtseeker

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅mtseeker

人线粒体变体分析的生物导体工具

生物导体版本:3.10

线粒体遗传学的变体分析工具。

作者:Tim Triche [CRE,AUT],Noor Sohail [AUT],Ben Johnson [aut],Tim Vickers [CTB],Azif Zubair [CTB]

维护者:蒂姆·特里奇(Tim Triche)

引用(从r内,输入引用(“ mtseeker”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mtseeker”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ mtseeker”)

html R脚本 mtseeker示例
PDF 参考手册

细节

生物浏览 遗传学,,,,代谢组学,,,,软件,,,,变体
版本 1.3.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(1。5年)
执照 GPL-3
要看 维里迪斯,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,变体
进口 XML2,utils,GMAPR, 方法,iranges,,,,生物酶,,,,循环,,,,jsonlite,图形,rsamtools,grdevices,生物弦,,,,rtracklayer,,,,变体工具,,,,同性恋,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,总结性特征
链接
建议 mtseekerdata,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,ggthemes,,,,GGPLOT2,,,,pkgdown,,,,尼特,,,,RSVG
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 mtseekerdata
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mtseeker_1.3.0.tar.gz
Windows二进制
Mac OS X 10.11(El Capitan) mtseeker_1.3.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mtseeker
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/mtseeker
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mtseeker/
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