此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅mtseeker。
生物导体版本:3.10
线粒体遗传学的变体分析工具。
作者:Tim Triche [CRE,AUT],Noor Sohail [AUT],Ben Johnson [aut],Tim Vickers [CTB],Azif Zubair [CTB]
维护者:蒂姆·特里奇(Tim Triche)
引用(从r内,输入引用(“ mtseeker”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mtseeker”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ mtseeker”)
html | R脚本 | mtseeker示例 |
参考手册 |
生物浏览 | 遗传学,,,,代谢组学,,,,软件,,,,变体 |
版本 | 1.3.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.8(R-3.5)(1。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | 维里迪斯,,,,S4VECTORS,,,,GenomeInfodB,,,,基因组签名,,,,变体 |
进口 | XML2,utils,GMAPR, 方法,iranges,,,,生物酶,,,,循环,,,,jsonlite,图形,rsamtools,grdevices,生物弦,,,,rtracklayer,,,,变体工具,,,,同性恋,,,,生物基因,,,,基因组机,,,,GenomicFeatures,,,,总结性特征 |
链接 | |
建议 | mtseekerdata,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,ggthemes,,,,GGPLOT2,,,,pkgdown,,,,尼特,,,,RSVG |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | mtseekerdata |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | mtseeker_1.3.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | mtseeker_1.3.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mtseeker |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/mtseeker |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mtseeker/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |