MSstatsTMT

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsTMT

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MSstatsTMT。

蛋白质意义分析猎枪质量spectrometry-based蛋白质组学实验与串联质量标签(TMT)标签

Bioconductor版本:3.10

猎枪质量工具对蛋白质意义分析spectrometry-based蛋白质组学实验与串联质量标签(TMT)标签。

作者:Ting黄(aut (cre)之一Meena崔(aut) Sicheng郝(aut),奥尔加Vitek (aut)

维护人员:黄Ting < thuang0703 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MSstatsTMT”)

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文档

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HTML	R脚本	MSstatsTMT用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件
版本	1.4.6
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6)
进口	limma,lme4,lmerTest,dplyr,tidyr,statmod、方法、reshape2,data.table,matrixStats,统计,跑龙套,ggplot2grDevices图形,MSstats
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	http://msstats.org/msstatstmt/
BugReports	https://groups.google.com/forum/ # ! / msstats论坛
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MSstatsTMT_1.4.6.tar.gz
Windows二进制	MSstatsTMT_1.4.6.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MSstatsTMT_1.4.6.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsTMT
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSstatsTMT
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MSstatsTMT/
包下载报告	下载数据