MSstatsSampleSize

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsSampleSize

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MSstatsSampleSize。

仿真工具的优化设计高维MS-based蛋白质组学实验

Bioconductor版本:3.10

包估计方差在输入蛋白质丰度数据和模拟数据与预定义的生物复制基于方差估计。它报告平均分类器的预测精度和平均蛋白模拟的重要性可以通过多次迭代。

作者:Ting黄(aut (cre)之一Meena崔(aut),奥尔加Vitek (aut)

维护人员:黄Ting < thuang0703 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MSstatsSampleSize”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MSstatsSampleSize”)

HTML	R脚本	MSstatsSampleSize用户指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类,DifferentialExpression,ExperimentalDesign,MassSpectrometry,PrincipalComponent,蛋白质组学,软件,可视化
版本	1.0.1
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(< 6个月)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6)
进口	ggplot2,BiocParallel,脱字符号,gridExtra,reshape2,统计,跑龙套,grDevices、图形MSstats
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	http://msstats.org
BugReports	https://groups.google.com/forum/ # ! / msstats论坛
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MSstatsSampleSize_1.0.1.tar.gz
Windows二进制	MSstatsSampleSize_1.0.1.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	MSstatsSampleSize_1.0.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsSampleSize
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSstatsSampleSize
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MSstatsSampleSize/
包下载报告	下载数据