MSSTATS

doi:10.18129/b9.bioc.msstats

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅MSSTATS

DDA,SRM和DIA中的蛋白质显着性分析,用于无标签或基于标签的蛋白质组学实验

生物导体版本:3.10

DDA,SRM和DIA实验中的一组用于统计相对蛋白质显着性分析的工具。

作者:Meena Choi [AUT,CRE],Tsung-Heng Tsai [AUT],Cyril Galitzine [aut],Olga Vitek [aut]

维护者:meena choi

引用(从r内,输入引用(“ MSSTATS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ msstats”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ MSSTATS”)

html R脚本 MSSTAT:蛋白质/肽的显着性分析
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 免疫学,,,,质谱,,,,正常化,,,,蛋白质组学,,,,QualityControl,,,,软件,,,,时间科
版本 3.18.5
在生物导体中 Bioc 2.13(R-3.0)(6。5年)
执照 艺术2.0
要看 R(> = 3.6)
进口 LME4,,,,Marray,,,,林玛,,,,GPLOTS,,,,GGPLOT2,方法,网格,Ggrepel,,,,预处理,,,,RESHAPE2,,,,生存,,,,Statmod,,,,minpack.lm,Utils,Grdevices,图形,统计信息,Dosnow,,,,,,,,foreach,,,,Data.Table,,,,大量的,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,扫帚,,,,purrr,,,,Stringr
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,MSSTATSBIODATA
系统要求
增强
URL http://msstats.org
BugReports https://groups.google.com/forum/#! Forum/msstats
取决于我
进口我 Artms,,,,msstatssamples,,,,MSSTATSTMT
建议我 MSSTATSBIODATA
链接到我
构建报告

包装档案

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源包 msstats_3.18.5.5.tar.gz
Windows二进制 msstats_3.18.5.5.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) msstats_3.18.5.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msstats
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/msstats
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/msstats/
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