MSNBase
doi：10.18129/b9.bioc.msnbase
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅MSNBase。
质谱和蛋白质组学的基础功能和类
生物导体版本：3.10
MSNBase提供了质谱和蛋白质组学数据的操纵，处理和可视化的基础架构，从原始到定量和注释数据。
Author: Laurent Gatto, Johannes Rainer and Sebastian Gibb with contributions from Guangchuang Yu, Samuel Wieczorek, Vasile-Cosmin Lazar, Vladislav Petyuk, Thomas Naake, Richie Cotton, Arne Smits, Martina Fisher, Ludger Goeminne, Adriaan Sticker and Lieven Clement.
维护者：laurent Gatto
引用（从r内，输入引用（“ MSNBase”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ msnbase”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ msnbase”）
| html | R脚本 | “ MSNBase”开发的简短介绍 |
| html | R脚本 | 基于MS的蛋白质组学的基本功能和类 |
| html | R脚本 | MSNBase基准测试 |
| html | R脚本 | MSNBase IO功能 |
| html | R脚本 | MSNBase：centroding copers-Mode MS数据 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | DataImport，，，，免疫学，，，，基础设施，，，，质谱，，，，蛋白质组学，，，，QualityControl，，，，软件 |
| 版本 | 2.12.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.8（R-2.13）（9年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.5.0），方法，生物基因（> = 0.7.1），生物酶（> = 2.15.2），MZR（> = 2.19.6），S4VECTORS，，，，蛋白质（> = 1.17.4） |
| 进口 | 生物比较，，，，iranges（> = 2.13.28），plyr，，，，预处理，，，，VSN，网格，Stats4，副词，，，，算，，，，pcamethods，，，，害怕（> = 1.16），mzid（> = 1.5.2），消化，，，，格子，，，，GGPLOT2，，，，XML，，，，秤，，，，大量的，，，，RCPP |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 测试，，，，普里尔，，，，栅格，，，，微实验，，，，动物园，，，，尼特（> = 1.1.0），洛尔，，，，rdisop，，，，proloc，，，，prolocdata（> = 1.7.1），MSDATA（> = 0.19.3），roxygen2，，，，RGL，，，，rpx，，，，AnnotationHub，，，，生物使用（> = 2.5.19），rmarkDown，，，，IMPUTELCMD，，，，规范，，，，GPLOTS，，，，闪亮的，，，，马格里特，，，，总结性特征 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://lgatto.github.io/msnbase |
| BugReports | https://github.com/lgatto/msnbase/issues |
| 取决于我 | metcirc，，，，MSMSEDA，，，，msmstests，，，，proloc，，，，prolocdata，，，，Prolocgui，，，，蛋白质组学，，，，proteoqc，，，，QPLEXANALYZER，，，，rforpoteomics，，，，突触，，，，XCMS |
| 进口我 | 自动调节器，，，，集团，，，，clumsid，，，，达帕尔，，，，Dapardata，，，，dep，，，，MSNID，，，，MSSTATSQC，，，，PBase，，，，峰板，，，，王子，，，，蛋白质组学杂志，，，，qplexdata，，，，rmassbank，，，，TopDownr |
| 建议我 | AnnotationHub，，，，生物室，，，，生物基因，，，，isobar，，，，MSDATA，，，，Proda，，，，QCMetrics，，，，读取，，，，rpx |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | msnbase_2.12.0.tar.gz |
| Windows二进制 | msnbase_2.12.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | msnbase_2.12.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msnbase |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/msnbase |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/msnbase/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
