DOI:10.18129 / B9.bioc.MOFA

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅

Multi-Omics因子分析(外交部)

Bioconductor版本:3.10

Multi-Omics因素分析:一个无监督框架的集成Multi-Omics数据集。

作者:Ricard Argelaguet,布丽塔一起创造Velten, Damien Arnol,御马布特尼,沃尔夫冈•休伯奥利弗Stegle

维护人员:布丽塔一起创造Velten <布丽塔一起创造。在embl.de velten >

从内部引用(R,回车引用(“遐”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“遐”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“遐”)

HTML R脚本 介绍遐
HTML R脚本 遐:应用单细胞multi-omics数据集
HTML R脚本 外交部:应用multi-omics慢性淋巴细胞白血病患者的数据集
HTML R脚本 外交部:如何评估模型的鲁棒性和模型选择
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 贝叶斯,DimensionReduction,软件,可视化
版本 1.2.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(1年)
许可证 LGPL-3 |文件许可证
取决于 R (> = 3.5)
进口 rhdf5,dplyr,reshape2,pheatmap,corrplot,ggplot2,ggbeeswarm、方法、尺度,GGally,RColorBrewer,cowplot,ggrepel,MultiAssayExperiment,Biobase,doParallel,foreach,网状,统计grDevices跑龙套
链接
建议 knitr,MOFAdata
SystemRequirements Python (> = 2.7.0)、numpy大熊猫,h5py, scipy, sklearn mofapy
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 MOFA_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 MOFA_1.2.0.zip(32位和64位)
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦) MOFA_1.2.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MOFA
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/遐差
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MOFA/
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