mmdiff2
doi：10.18129/b9.bioc.mmdiff2
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅mmdiff2。
CHIP-SEQ数据集的统计测试
生物导体版本：3.10
该软件包检测到不同芯片seq样品中读取富集曲线之间的统计学上显着差异。为了利用形状差异，它使用内核方法（最大平均差异，MMD）。
作者：Gabriele Schweikert [Cre，Aut]，David Kuo [aut]
维护者：Gabriele Schweikert
引用（从r内，输入引用（“ mmdiff2”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ mmdiff2”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ mmdiff2”）
| R脚本 | MMDIFF2方法的简介 | |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | chipseq，，，，差异词，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.14.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（4年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3），rsamtools，，，，生物酶 |
| 进口 | 基因组机，，，，Locfit，，，，BSGENOME，，，，生物弦，，，，闪亮的，，，，GGPLOT2，，，，rcolorbrewer，图形，grdevices，并行，S4VECTORS， 方法 |
| 链接 | |
| 建议 | mmdiffbamsubset，，，，主题，，，，尼特，，，，生物使用，，，，bsgenome.mmusculus.ucsc.mm9 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | mmdiffbamsubset |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | mmdiff2_1.14.0.tar.gz |
| Windows二进制 | mmdiff2_1.14.0.zip（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | mmdiff2_1.14.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mmdiff2 |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/mmdiff2 |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/mmdiff2/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
