米格莎

DOI：10.18129 / b9.bioc.migsa.

此套餐适用于Biocumonds 3.10版;对于稳定的最新版本版本，请参阅米格莎。

巨大综合基因集分析

生物导体版本：3.10

大规模综合基因集分析。MIGSA包允许同时在若干表达和基因上进行大规模和整合的基因集分析。它提供了常见的基因表达分析框架，授予全面和相干的分析。仅通过最佳可用方法，即分别提供最佳的方式，仅以一体化的方式执行单数和基因设定富集分析。这种大OMICS数据工具的最大优势是探索，分析和可视化其结果的多个功能，以便于通过巨大信息来源进行数据挖掘任务。MIGSA包还提供了多种功能，可以轻松地从几个存储库中加载最新的基因集。

作者：Juan C. Rodriguez，Cristobal Fresno，Andrea S. Llera和Elmer A. Fernandez

维护者：Juan C. Rodriguez

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“3.6”）并输入：

if（！qualocamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“migsa”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“MIGSA”）

PDF.	r script.	获取PBCMC数据集
PDF.	r script.	获取TCGA数据集
PDF.	r script.	巨大综合基因集分析
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	基因表达那GenesetenRichment.那ke那微阵列那rnaseq.那软件那可视化
版本	1.10.1
在生物导体中以来	BIOC 3.5（R-3.4）（3年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	R（> = 3.4），方法，生物根系
进口	annotationdbi.那BioBase.那生物相投，编译器，data.table.那edger.那徒劳。霍尔格那ggdendro那ggplot2.那go.db.那古司裤那图形，图形，grdevices，grid，GSEABASE.那ismev.那林马那MatrixStats.那org.hs.eg.db.那RBGL.那重塑2.那rghrachviz那rjsonio.，统计数据，utils，素食主义者
链接到
建议	乳房母亲那Breastcancernki.那乳房法人传动系统那乳房公务员那乳腺癌那Breastcancervdx.那MGSZ.那migsadata.
系统要求
加强
URL.	https://jcrodriguez.rbind.io/
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	migsa_1.10.1.tar.gz.
Windows二进制文件	migsa_1.10.1.zip.
Mac OS x 10.11（El Capitan）	migsa_1.10.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/migsa.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/米格莎
包短网址	https://biocumon.org/packages/migsa/
包裹下载报告	下载统计信息