餐
DOI:10.18129 / B9.bioc.MEAL
此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见餐．
进行甲基化分析
Bioconductor版本:3.10
包集成甲基化和表达数据。它也可以单独进行甲基化或表达分析。包括了一些绘图功能，以及基于冗余分析的新的区域分析。snp对一个区域的影响也可以被估计。
作者:Carlos Ruiz-Arenas [aut, cre]， Juan R. Gonzalez [aut]
维护者:Carlos Ruiz-Arenas < Carlos .ruiz at isglobal.org>
引文(从R内，输入引用(“餐”))：
安装
要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MEAL")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“餐”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | MEAL表达及甲基化分析 |
| 超文本标记语言 | R脚本 | 甲基化分析与MEAL |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | DNAMethylation,微阵列,软件,WholeGenome |
| 版本 | 1.16.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (>= 3.2.0)，Biobase,MultiDataSet |
| 进口 | GenomicRanges,limma,DMRcate,素食主义者,BiocGenerics,minfi,IRanges,S4Vectors，方法，并行，ggplot2(> = 2.0.0),交换,Gviz,missMethyl,isva,SummarizedExperiment,SmartSVA，图形，统计，utils，matrixStats |
| 链接 | |
| 建议 | testthat,IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,knitr,minfiData,BiocStyle,rmarkdown,brgedata |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | MEAL_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MEAL_1.16.0.zip |
| Mac OS X 10.11 (El Capitan) | MEAL_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MEAL |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MEAL |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MEAL/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
