MCbiclust

DOI:10.18129 / B9.bioc.MCbiclust

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见MCbiclust

基因表达数据的海量相关双聚类及其相关方法

Bioconductor版本:3.10

定制的算法和相关方法,用于发现,可视化和分析大型基因表达数据集中的双簇。算法基于提供的大小为n的基因集,从数据集中寻找包含m个样本的最大强度相关矩阵。

作者:罗伯特·边沁

维护者:Robert Bentham < Robert . Bentham。11在ucl.ac.uk>

引文(从R内,输入引用(“MCbiclust”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MCbiclust")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“MCbiclust”)

超文本标记语言 R脚本 MCbiclust介绍
PDF 参考手册

细节

biocViews 聚类GeneExpressionImmunoOncology微阵列RNASeq软件StatisticalMethod
版本 1.10.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(3年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.4)
进口 BiocParallel,图形,utils,统计,AnnotationDbiGO.dborg.Hs.eg.dbGGallyggplot2尺度集群WGCNA
链接
建议 gplotsknitrrmarkdownBiocStylegProfileR质量dplyr老鸨devtoolstestthatGSVA
SystemRequirements
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 MCbiclust_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 MCbiclust_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) MCbiclust_1.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MCbiclust
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MCbiclust
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MCbiclust/
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