mbttest

doi:10.18129/b9.bioc.mbttest

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅mbttest

多个βt检验

生物导体版本:3.10

MBTTEST方法是从Baggerly等(2003)的Beta t检验方法开发的。与Bayseq(Hard Castle and Kelly 2010),Deseq(Anders and Huber 2010)和精确测试相比(Robinson and Smyth 2007,2008)和McCarthy等人的GLM(2012),MBTTEST具有很高的工作效率,即,即,即它具有高功率,FDR估计的高保守性和高稳定性。MBTTEST适合转录组合数据,标签数据,SAGE数据(计数数据)或一些重复的库。它可用于鉴定两个条件之间差异表达的基因,mRNA同工型或标签。

作者:Yuan-de tan

维护者:yuan-de tan

引用(从r内,输入引用(“ mbttest”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mbttest”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ mbttest”)

PDF R脚本 用“ mbttest”软件包分析RNA-Seq计数数据
PDF mbttest-manual.pdf
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 替代方案,,,,覆盖范围,,,,差异性,,,,差速器,,,,基因表达,,,,多重组合,,,,智者,,,,测序,,,,软件,,,,转录
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.3(R-3.3)(4年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3.0),统计,GPLOTS,,,,gtools,图形,基础,utils,grdevices
进口
链接
建议 生物使用,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mbttest_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 mbttest_1.14.0.zip(32-和64位)
Mac OS X 10.11(El Capitan) mbttest_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbttest
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/mbttest
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/mbttest/
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