M3Drop

DOI:10.18129 / B9.bioc.M3Drop

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅M3Drop。

Michaelis-Menten造型在单细胞RNASeq辍学

Bioconductor版本:3.10

这个包适合Michaelis-Menten模型在单细胞RNASeq辍学的模式数据。这个模型作为零识别显著变量(即差异表达)基因用于下游分析,如聚类细胞。

作者:塔卢拉安德鲁斯< tallulandrews gmail.com >

维修工:塔卢拉安德鲁斯< tallulandrews gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“M3Drop”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“M3Drop”)

PDF	R脚本	介绍M3Drop
PDF		参考手册
文本		自述
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,DimensionReduction,FeatureExtraction,GeneExpression,RNASeq,测序,软件,转录组
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(3.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4),numDeriv
进口	RColorBrewer,gplots,bbmle,statmodgrDevices,图形,统计数据,matrixStats,矩阵,irlba,reldist,Hmisc、方法
链接
建议	ROCR,knitr,M3DExampleData,嘘,SingleCellExperiment,单片眼镜,修拉,Biobase
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/tallulandrews/M3Drop
BugReports	https://github.com/tallulandrews/M3Drop/issues
取决于我
进口我	scMerge
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	M3Drop_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	M3Drop_1.12.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	M3Drop_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/M3Drop
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ M3Drop
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/M3Drop/
包下载报告	下载数据