M3D
doi：10.18129/b9.bioc.m3d
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅M3D。
确定跨测试组的差异甲基化区域
生物导体版本：3.10
该软件包在统计学上确定了CPG的统计学显着差异化区域。它使用内核方法（最大平均差异）来测量甲基化曲线的差异，并将这些方法与重新复制变化联系起来，同时考虑了覆盖范围的变化。
作者：汤姆·梅奥
维护者：汤姆·梅奥（Tom Mayo）
引用（从r内，输入引用（“ M3D”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ m3d”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ M3D”）
| R脚本 | M $^3 $ D方法的简介 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 覆盖范围，，，，CPGISLAND，，，，DNAMETHYLATY，，，，差甲基化，，，，软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.0（R-3.1）（5。5年） |
| 执照 | 艺术许可2.0 |
| 要看 | r（> = 3.3.0） |
| 进口 | 平行，RCPP，，，，生物基因，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机，，，，总结性特征，，，，Biseq |
| 链接 | RCPP |
| 建议 | 生物使用，，，，尼特，，，，测试 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | m3d_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | M3D_1.20.0.ZIP（32-和64位） |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | m3d_1.20.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/m3d |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/m3d |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/m3d/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
