Lowmaca

doi:10.18129/b9.bioc.lowmaca

此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Lowmaca

Lowmaca-通过共识比对的低频突变分析

生物导体版本:3.10

Lowmaca包装是一套简单的工具套件,可通过共识比对调查和分析几种蛋白质或PFAM结构域的突变曲线。您可以使用我们的软件包进行假设驱动的探索性分析,简单地提供您感兴趣的一组基因或PFAM领域。

作者:Stefano de Pretis,Giorgio Melloni

维护者:stefano de Pretis ,giorgio melloni

引用(从r内,输入引用(“ Lowmaca”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ lowmaca”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Lowmaca”)

html R脚本 HTML文档的生物导体样式
PDF 参考手册
文本 读书我
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,DataImport,,,,乘以quessequealignment,,,,测序,,,,测序,,,,软件,,,,somaticmmut,,,,全媒体
版本 1.16.0
在生物导体中 Bioc 3.1(R-3.2)(5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 2.10)
进口 CGDSR, 平行,Stringr,,,,RESHAPE2,,,,Data.Table,,,,rcolorbrewer, 方法,低量表,,,,生物比较,,,,Motifstack,,,,生物弦,,,,httr, 网格,Gridbase
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown
系统要求 Clustalo,GS,Perl
增强
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构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 lowmaca_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 lowmaca_1.16.0.zip
Mac OS X 10.11(El Capitan) lowmaca_1.16.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lowmaca
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/lowmaca
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/lowmaca/
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