此软件包适用于生物导体的3.10版;对于稳定的最新版本,请参阅Lowmaca。
生物导体版本:3.10
Lowmaca包装是一套简单的工具套件,可通过共识比对调查和分析几种蛋白质或PFAM结构域的突变曲线。您可以使用我们的软件包进行假设驱动的探索性分析,简单地提供您感兴趣的一组基因或PFAM领域。
作者:Stefano de Pretis,Giorgio Melloni
维护者:stefano de Pretis
引用(从r内,输入引用(“ Lowmaca”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 3.6”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ lowmaca”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Lowmaca”)
html | R脚本 | HTML文档的生物导体样式 |
参考手册 | ||
文本 | 读书我 | |
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,DataImport,,,,乘以quessequealignment,,,,测序,,,,测序,,,,软件,,,,somaticmmut,,,,全媒体 |
版本 | 1.16.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.1(R-3.2)(5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 2.10) |
进口 | CGDSR, 平行,Stringr,,,,RESHAPE2,,,,Data.Table,,,,rcolorbrewer, 方法,低量表,,,,生物比较,,,,Motifstack,,,,生物弦,,,,httr, 网格,Gridbase |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown |
系统要求 | Clustalo,GS,Perl |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | lowmaca_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | lowmaca_1.16.0.zip |
Mac OS X 10.11(El Capitan) | lowmaca_1.16.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lowmaca |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/lowmaca |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/lowmaca/ |
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