Logolas

DOI:10.18129 / B9.bioc.Logolas

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Logolas。

EDLogo情节以字符串标识和自适应缩放Position-Weight矩阵

Bioconductor版本:3.10

生产标志情节突出浓缩和损耗的字符,允许字符串符号的绘制,并执行缩放position-weights自适应,连同几个有趣的格式化。

作者:Kushal戴伊(aut (cre),东岳谢(aut),彼得Carbonetto(施),马修·斯蒂芬斯(aut)

维护人员:Kushal戴伊< kkdey uchicago.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Logolas”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“Logolas”)

HTML	R脚本	引导Logolas教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐,贝叶斯,SequenceMatching,软件,可视化
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(3年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.4)
进口	网格,SQUAREM,LaplacesDemon、统计数据、图形,跑龙套,ggplot2,gridBase,Biostrings
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,Biobase,devtools,xtable,gridExtra,RColorBrewer,seqLogo,ggseqlogo
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/kkdey/Logolas
BugReports	http://github.com/kkdey/Logolas/issues
取决于我
进口我
建议我	universalmotif
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Logolas_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	Logolas_1.10.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	Logolas_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Logolas
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Logolas
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Logolas/
包下载报告	下载数据