此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见LinkHD.
Bioconductor版本:3.10
在这里,我们提出了Link-HD,一种集成异构数据集的方法,作为stat - act(“结构化表三指数统计分析组合表”)的推广,一系列方法来连接和比较来自多个子空间的信息。但是,由于cpi - act只允许连续数据,无法建立样本与特征之间的关系,因此存在一定的缺陷。为了解决这些限制,我们结合了多个距离选项和基于线性回归的双标图模型,以建立观测值和变量之间的关系,并进行变量选择。
作者:Laura M. Zingaretti [aut, cre]
维护者:“Laura M Zingaretti”< M .lau。Zingaretti在gmail.com>
引文(从R内,输入引用(“LinkHD”)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“LinkHD”)
超文本标记语言 | R脚本 | 注释基因组变异 |
参考手册 |
biocViews | 分类,MultipleComparison,回归,软件 |
版本 | 1.0.0 |
在Bioconductor | BioC 3.10 (R-3.6)(< 6个月) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R(>= 3.6.0),方法,ggplot2,统计数据 |
进口 | 尺度,集群、图形、ggpubr,gridExtra,素食主义者,里约热内卢,MultiAssayExperiment,emmeans,reshape2,data.table |
链接 | |
建议 | 质量(> = 7.3.0),knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | LinkHD_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | LinkHD_1.0.0.zip |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | LinkHD_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LinkHD |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LinkHD |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LinkHD/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |