此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见林肯.
Bioconductor版本:3.10
该软件包提供了计算lincrna和蛋白质编码基因共表达网络的方法。根据“关联有罪”方法,与蛋白质编码基因集相关的生物学术语预测lincrna的生物学上下文。
作者:Manuel Goepferich, Carl Herrmann
维修员:曼努埃尔·戈普费里希<曼努埃尔。在gmx.de goepferich >
引用(从R中,输入引用(林肯)
):
要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(林肯)
超文本标记语言 | R脚本 | LINC - lincrna的共表达分析 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BiologicalQuestion,GeneExpression,GeneRegulation,软件 |
版本 | 1.14.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.4 (R-3.3)(3.5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R(>= 3.3.1),方法,统计 |
进口 | Rcpp(> = 0.11.0)它,剂量,ggtree,gridExtra,猿、网格png,Biobase,股东价值分析,reshape2, grDevices跑龙套org.Hs.eg.db,clusterProfiler,ggplot2,ReactomePA |
链接 | Rcpp |
建议 | RUnit,BiocGenerics,knitr,biomaRt |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | LINC_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | LINC_1.14.0.zip(32位和64位) |
Mac OS X 10.11 (El Capitan) | LINC_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LINC |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/林肯 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/LINC/ |
包下载报告 | 下载数据 |