接口
doi：10.18129/b9.bioc.junctionseq
此软件包适用于生物导体的3.10版；对于稳定的最新版本，请参阅接口。
接口：RNA-seq数据中检测差分外显子和剪接结的用法的实用程序
生物导体版本：3.10
RNA-Seq数据中差分外显子或剪接结构使用情况检测和可视化的实用程序。
作者：Stephen Hartley [AUT，CRE]（博士学位），Simon Anders [CPH]，Alejandro Reyes [CPH]
维护人员：Stephen Hartley
引用（从r内，输入引用（“ innctionseq”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 3.6”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ innctionseq”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ innctionseq”）
| 接口式小插图 | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 差异性，，，，免疫学，，，，rnaseq，，，，测序，，，，软件 |
| 版本 | 1.16.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.3（R-3.3）（4年） |
| 执照 | 文件执照 |
| 要看 | R（> = 3.2.2），方法，总结性特征（> = 0.2.0），RCPP（> = 0.11.0），rcpparmadillo（> = 0.3.4.4） |
| 进口 | deseq2（> = 1.10.0），Statmod，，，，HMISC，，，，plotrix，，，，Stringr，，，，生物酶（> = 2.30.0），Locfit，，，，生物基因（> = 0.7.5），生物比较，，，，GeneFilter，，，，Geneplotter，，，，S4VECTORS，，，，iranges，，，，基因组机 |
| 链接 | RCPP，，，，rcpparmadillo |
| 建议 | 大量的，，，，尼特，，，，JCTSEQDATA，，，，生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | 开罗，，，，普里尔 |
| URL | http://hartleys.github.io/junctionseq/index.html |
| BugReports | https://github.com/hartleys/junctionseq/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 途径图 |
| 建议我 | JCTSEQDATA |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | inctionseq_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | inctionseq_1.16.0.zip |
| Mac OS X 10.11（El Capitan） | inctionseq_1.16.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/junctionseq |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/innctionseq |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/junctionseq/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
