ImmuneSpaceR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ImmuneSpaceR

此包适用于Bioconductor的3.10版本;有关稳定的最新发布版本，请参见ImmuneSpaceR．

免疫空间数据库的薄包装

Bioconductor版本:3.10

提供一个方便的API，用于访问免疫空间(www.immunespace.org)中的数据集，免疫空间是人类免疫项目联盟(HIPC)的数据存储库和分析平台。

作者:Greg Finak [aut]， Renan Sauteraud [aut]， Mike Jiang [aut]， Gil Guday [aut]， Leo Dashevskiy [aut]， Evan Henrich [aut]， Ju Yeong Kim [aut]， Lauren Wolfe [aut]， Helen Miller [aut]， Raphael Gottardo [aut]， ImmuneSpace Package Maintainer [cre, cph]

Maintainer: ImmuneSpace Package Maintainer < ImmuneSpace at gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ImmuneSpaceR")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“ImmuneSpaceR”)

超文本标记语言	R脚本	免疫空间包简介
超文本标记语言	R脚本	使用getDataset下载数据集
超文本标记语言	R脚本	用ImmuneSpaceR处理表达矩阵
超文本标记语言	R脚本	interactive_netrc()函数演练
超文本标记语言	R脚本	SDY144: HAI/病毒中和效价与细胞计数的相关性
超文本标记语言	R脚本	SDY180:用多参数流式细胞术测定血浆胞浆体的丰度
超文本标记语言	R脚本	SDY269: HAI与流式细胞仪和ELISPOT结果的相关性
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，DataRepresentation，软件，ThirdPartyClient
版本	1.14.1
在Bioconductor公司	BioC 3.3 (R-3.3)(四年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	跑龙套,R6，data.table，旋度，httr，Rlabkey(> = 2.3.1),Biobase，pheatmap，ggplot2(> = 3.2.0),尺度统计数据,gplots，情节，的热图(> = 0.7.0),jsonlite，rmarkdown，preprocessCore，flowCore，flowWorkspace，消化
链接
建议	knitr，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR
BugReports	https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR/issues
全靠我
进口我
建议我
给我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	ImmuneSpaceR_1.14.1.tar.gz
Windows二进制	ImmuneSpaceR_1.14.1.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	ImmuneSpaceR_1.14.1.tgz
源库	git clone https://git.bioconductor.org/packages/ImmuneSpaceR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ImmuneSpaceR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ImmuneSpaceR/
软件包下载报告	下载数据