IPPD

DOI:10.18129 / B9.bioc.IPPD

这个包是3.10版本的Bioconductor;有关稳定的、最新的发布版本，请参见IPPD。

模板匹配的蛋白质质谱同位素峰模式反褶积

Bioconductor版本:3.10

该包提供了从原始质谱中提取同位素峰模式的功能。这是通过拟合大量模板基函数到原始谱使用非负最小二乘或最小绝对偏差拟合。该包提供了一个灵活的功能，试图以一种适合数据中的峰值形状的方式估计模型参数。该包还提供了处理LCMS运行的功能。

作者:Martin Slawski ， Rene Hussong < Rene。hussong大学。lu>， Andreas Hildebrandt < Andreas。hildebrandt at uni-mainz.de>， Matthias Hein < Hein at chs .uni-saarland.de>

维护者:Martin slaski

安装

要安装此包，请启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" ipd ")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“IPPD”)

PDF	R脚本	IPPD手册
PDF		参考手册

细节

biocViews	蛋白质组学,软件
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 2.8 (R-2.13)(9年)
许可证	GPL(版本2或更高版本)
取决于	R (> = 2.12.0),质量,矩阵,XML,消化,bitops
进口	方法、统计图形
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	RforProteomics
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	IPPD_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	IPPD_1.34.0.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan)	IPPD_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IPPD
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IPPD
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IPPD/
包下载报告	下载数据