检查

DOI:10.18129 / B9.bioc.INSPEcT

此包适用于Bioconductor 3.10版本;有关稳定的最新发布版本,请参见检查

利用RNA-seq数据建模RNA合成、处理和降解

Bioconductor版本:3.10

INSPEcT(从转录组数据中推断合成、处理和降解率)RNA-seq数据在时间过程实验或稳态条件下,有或没有新生RNA数据的支持。

作者:Stefano de Pretis

维护人员:Stefano de Pretis , Mattia Furlan

引文(从R内,输入引用(“检查”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("INSPEcT")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“检查”)

超文本标记语言 R脚本 从转录组数据推断合成、处理和降解率
超文本标记语言 R脚本 INSPEcT_GUI.html
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneRegulationRNASeq测序软件SystemsBiologyTimeCourse
版本 1.16.3
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(4.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R(>= 3.5),方法,BiobaseBiocParallel
进口 pROCdeSolverootSolveKernSmoothgdataGenomicFeaturesGenomicRangesIRangesBiocGenericsGenomicAlignmentsRsamtoolsS4VectorsGenomeInfoDbDESeq2plgemSummarizedExperimentTxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene闪亮的
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 INSPEcT_1.16.3.tar.gz
Windows二进制 INSPEcT_1.16.3.zip
Mac OS X 10.11 (El Capitan) INSPEcT_1.16.3.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/INSPEcT
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/INSPEcT
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/INSPEcT/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网