IMMAN

DOI:10.18129 / B9.bioc.IMMAN

这个包是3.10版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅IMMAN。

Interlog蛋白质网络重建通过映射和挖掘分析

Bioconductor版本:3.10

重建Interlog蛋白质网络(IPN)集成来自多个蛋白质相互作用网络(PPINs)。我使用这个包,覆盖不同PPINs守恒的不同物种之间常见的网络将适用。

作者:Minoo阿什蒂亚尼,Payman Nickchi, Abdollah Safari, Mehdi Mirzaie, Mohieddin贾法里

维护人员:Minoo阿什蒂亚尼<阿什蒂亚尼。在gmail.com minoo >

安装

安装这个包,开始R(版本“3.6”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“IMMAN”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“IMMAN”)

HTML	R脚本	IMMAN
PDF		参考手册

细节

biocViews	对齐,GraphAndNetwork,网络,蛋白质组学,SequenceMatching,软件,SystemsBiology
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(2年)
许可证	艺术- 2.0
取决于
进口	STRINGdb,Biostrings,igraph,图形,跑龙套,seqinr
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	IMMAN_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	IMMAN_1.6.0.zip
Mac OS X 10.11(埃尔卡皮坦)	IMMAN_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IMMAN
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IMMAN
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IMMAN/
包下载报告	下载数据